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現在植物學研究中，葉綠素熒光儀是一個很重要的研究工具。該儀器是很理想的野外研究應用儀器，能夠實現非破壞性測量。數據可以直接記錄在內存中，數據很容易下載并進行簡單分析。還可以做溫室培養(yǎng)，作物病害評估，環(huán)境評價，園藝學，農學，林學，水生物學，毒理學，突變株篩選，遺傳育種等。

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手持式葉綠素熒光儀植物生理生態(tài)研究，其能量的傳遞與分配、反應中心的狀態(tài)，過剩能量的耗散以及反映光合作用的光抑制和光破壞。應用葉綠素熒光可以對植物材料進行原位、無損傷的檢測，且操作步驟簡單。所以葉綠素熒光越來越受到人們的青睞，在光合生理和逆境生理等研究領域有著廣泛的應用。